Suomen Egyptologinen Seura järjestää seuraavaa toimintaa:
- Järjestää kokouksia ja julkisia yleisöluentoja kerran kuukaudessa kevät- ja syyskaudella.
- Järjestää kerran vuodessa, yleensä maaliskuussa, vuosikokouksen ja vuosijuhlan.
- Kaksi kertaa vuodessa ilmestyvä Kirjuri-jäsenlehti.
- Julkaisee muinaiseen Egyptiin ja egyptologiaan liittyviä kirjoja.
- Järjestää näyttelyitä.
- Järjestää matkoja egyptologisiin kohteisiin ja kokoelmiin.